Posebnu pozornost treba obratiti na čistoću tijekom postavljanja alata. Bilo da se radi o gruboj ili završnoj obradi, čistoća alata za bušenje mora se održavati u svakoj fazi postavljanja i sastavljanja. Držač alata mora se temeljito očistiti prije sastavljanja s alatnim strojem, a umetci se moraju zamijeniti. Nepažnja je nedopustiva.
Prethodno-podešavanje alata je ključno; njegova dimenzijska točnost i stanje moraju ispunjavati zahtjeve. Za alate za bušenje s indeksiranjem, osim za alate za bušenje s jednim-rubom, ručno probno rezanje se općenito ne koristi, zbog čega je pred-namještanje prije strojne obrade iznimno važno. Dimenzije pred-namještanja moraju biti precizne, podešene na donju granicu tolerancije, a prilagodbe i kompenzacije trebaju se izvršiti kako bi se uzeli u obzir čimbenici temperature. Prethodno-podešavanje alata može se izvesti korištenjem namjenskog instrumenta za pred-podešavanje, na-podešivaču alatnog stroja ili drugim mjernim instrumentima.
Nakon ugradnje alata potrebno je izvršiti provjeru dinamičkog odstupanja. Dinamičko odstupanje je sveobuhvatan pokazatelj koji odražava točnost vretena alatnog stroja, alata i točnosti veze između alata i alatnog stroja. Ako ta točnost prelazi 1/2 ili 2/3 potrebne točnosti rupe koja se obrađuje, obrada se ne može nastaviti. Uzrok se mora identificirati i ukloniti prije nastavka obrade. Operateri moraju zapamtiti ovu točku i strogo je se pridržavati. Inače, obrađene rupe neće zadovoljiti zahtjeve.
Životni vijek svakog dijela alata treba odrediti statističkim ili ispitnim metodama kako bi se osigurala pouzdanost točnosti strojne obrade. Ovaj je zahtjev manje strog za-alate za bušenje s jednom oštricom, ali je posebno važan za-alate za bušenje s više oštrica. Karakteristike obrade alata za bušenje s indeksiranjem su: prethodno-podešavanje alata, postizanje potrebne obrade u jednom prolazu i osiguravanje da se alat ne ošteti; inače može doći do nepotrebnih nezgoda.
